旋風除塵器具有除塵效率較高，結構簡單，制作容易，在安裝上也比較方便的優點。因此，現在旋風除塵器廣泛應用于化工等重要領域。尤其是鍋爐除塵應用的比較廣泛，但是有的用戶在使用中還存在著一些問題。
1、系統阻力和引風機的全壓不相適應
旋風除塵器是利用含塵煙氣在旋風除塵器的內部做旋轉的運動，在離心作用力的作用下達到除塵的目的。氣體運動所消耗的能量，反應為除塵器的阻力。每種旋風除塵器的阻力大小可以通過公式計算，也可以從特征曲線表中查的。在選擇除塵器時，要根據煙道的系統阻力和陰風及全壓來決定。包括旋風除塵器在內，煙道的總阻力不能大于風機全壓的85-90%，因管道須安裝平直，盡量的少拐彎，切切忌拐90°的彎如果阻力太大，_引風機的全壓，則造成排煙量減少，除塵效率降低，鍋爐會冒黑煙，反之，風機全壓過大，會造成動力的浪費和處理煙氣量過大，鍋爐的熱負荷降低。因而管路總阻力和引風機的全壓配備要合適。
2、選擇旋風尺寸器的效率不切合實際
人們總是要選擇阻力低，除塵效率高的除塵器，除塵效率的高低是和煙塵的性質、顆粒的大小、煙氣的粘度小_含塵煙氣進入旋風除塵器的進口速度等有關系的。比如煙塵的顆粒大，進口濃度高、速度快，比重大的除塵器效率高，反之低。
旋風除塵器的效率是在實驗室或現場通過冷態，熱態的實驗測定的，因而它具有特定的條件。用戶在選用旋風除塵器時，要將本單位的具體條件和實驗條件盡量結合起來考慮。否則看到某個除塵器的除塵效率高選用是不行的。條件變化除塵器的餓除塵效率也會隨著變化，選用除塵器時要注意這一點。
3、粒級效率經常地不被人們重視
粒級效率是反映旋風除塵器對不同的粒級的煙塵捕集下來的多少。如果鍋爐排放的煙塵很細，粒級效率低，排放的煙塵很粗，粒級效率高。因此選擇旋風除塵器時，應將鍋爐的派飯細度和除塵器的粒級效率綜合起來考慮。
4、對煙塵的磨損旋風除塵器的嚴重性重視不夠
在旋風除塵器中，煙塵對器壁的磨損是不可避免的，但是我們應該盡力的改良，病假涂料。
5、管路或旋風除塵器的漏風
過濾上配用的旋風除塵器，基本上都處于負壓狀態運行，由于管理不善，管路或旋風除塵器漏風，結果造成鍋爐排煙量的減少，冒黑煙，蒸發量下降。如果旋風除塵器的漏風量在處理煙氣量的10%左右，除塵效率將接近于0.在管路的接頭，盡量愛用石棉墊，石棉繩等封嚴避免漏風。
6、除塵器運行時應注意保溫。
旋風除塵器在運行的過程中，由于煙氣的溫度高，含濕量大，在停爐后，旋風除塵器在冬季容易產生冷凝水結冰。堵塞下灰口，這是不能夠用力敲打旋風吃醋很氣的下椎體，以防止變形或脫落。
7、除塵器串聯或并聯時存在的問題
如果_除塵器的煙塵排空濃度達到排放標準時，不應用二級串聯除塵器，這樣的兩級除塵器的阻力增大，耗電量多。如果_除塵器的煙塵排空濃度達不到排放標準時，可以采用二級串聯除塵器。
旋風除塵器并聯使用的較多，由于鍋爐的排煙量較大，一臺旋風除塵器滿足不了要求時，可以采用兩個或四個分成一組或兩組并聯使用，并聯后的除塵器應防止漏氣，并用灰斗時，勁量防止相互串風，混風會使除塵器的效率下降。
8、對收下來的灰塵處理不當
有些鍋爐雖然配有除塵器，但對于捕集下來的煙塵處理不當，被風吹的到處都是，嚴重的污染了地面的環境，應該注意回收加強管理，進行綜合利用變廢為寶。